故事发生在一间名为“燕雀”的侦探社之中，坐镇其中的，是名为洛基（樱井孝宏 配音）的美少年侦探。虽然表面上看来只是一个小孩子，但洛基的真身其实是北欧神话中的邪神，因为作恶多端而被放逐人间，在此期间陪伴着洛基，照料他饮食起居的，是原型为一条巨蟒的暗野龙介（三木真一郎 配音）。 一次偶然中，一个名为大堂寺茧良（堀江由衣 配音）在无意之间闯入了燕雀侦探社之中，她希望洛基能够帮助她替一个会说话的洋娃娃找到曾经的主人。一番波折之后，事件总算顺利解决，而在此之后，茧良竟然自说自话地成为了洛基的助手，两人一同面对的，是各式各样科学难以解释的灵异事件。
娇小害羞的千濑（前田亚季 饰）一直暗恋着同班同学修次（洼冢俊介 饰），终于，在鼓起勇气向修次表白之后，千濑和修次之间纯白的爱情之花绽放了。一天，札幌的上空突然飞来了大量的轰炸机，战争开始了，也就是从那时起，修次发现了深藏在千濑体内的秘密——向来人畜无害的千濑竟然被军方残忍的改造成为了“最终武器”。 尽管心中充满了恐惧与不忍，但只要遭到了攻击，千濑的身体就会不受控制地做出自卫反击，就这样，在短暂的幸福之后，千濑绝望而又无助的，作为兵器的余生开始了。看着身体和心灵都千疮百孔的女友，修次无法说出宽慰之语，他只能通过行动，默默的陪伴在千濑的身边。
在那遥远的唐朝，有一个小村庄，村里住着以王兄、李兄为首的一群文人朋友——诗情画意的水墨风田园故事，历史人物趣味新说，带你走近和课本上不一样的不靠谱王李二人。（共31话：序章+正片13话+番外12话 ）
省吾達の帰還から数百年が経った時代。人々はコンピューターシステムに支配された街「エデンシティ」で暮らしていた。それは、かつての人類の過ちを繰り返さない為に取られた手段だった。しかし、その支配を嫌ったレジスタンスによる反攻作戦が開始される。 そして明らかになった支配者ウォン・ダイの正体は、あの矢作省吾だった。地球に帰還した際、彼を7Gのオペレーターと認めなかったクリエーター達は、バーチャルではなく人間であるオリジナル・イヴと彼との接触を恐れ、システムの操り人形ウォン・ダイと化してしまったのだった。 省吾はその支配から開放された直後、後を本作の主人公であるエイジ・タカナカに託して死んでしまう。それを知ったイヴは単身、A.D.A.M.へ向かう。人々を救う為……。
