本剧讲述超级飞侠与超级宠物们继续乘着迷你基地前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在山东潍坊，他们帮助小宝成功放飞了巨型章鱼风筝；在菲律宾，他们通过特制音响和扩音设备，帮助一个叫利娅的女孩达成了和鱼儿交朋友、一起唱歌的愿望。尽管遇到不少困难，但超级飞侠和超级宠物们每次都会用炫酷的装备和丰富想象力的办法，圆满地解决问题。
在这个世界中，存在着一种“中间人”，他们可以吸收自杀者的生命粒子，并利用这些生命粒子延续濒死之人的生命。“中间人”叶晰的搭档尚敏突然失踪，在寻找尚敏的过程中，他发现了自己所处的组织的一些不为人知的黑暗。而这些，都和一个名为“克洛托”的计划有关……
被“母亲病危”的消息骗到海外的高中生海棠晴，在那里突然被介绍认识了是“你的弟弟！”的名叫海棠零的男孩子。 海棠晴拼命地照料着谁的话都不听的野生儿海棠零，而海棠零的身世似乎也是一个秘密，加之，在海棠零终于能开始亲近自己时，一场悲剧发生在海棠晴身上。 5年后，与长大了的海棠零再会的晴又将面临怎样的生活呢？
