她们是生前来自不同时期的少女，集结成为特别的偶像团体，目标只有一个：唱吧！跳吧！战斗吧！现在，少女们卷土重来，再次登上了舞台！
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
这是一个设定在乡村场景下，却属于我们所有人的童年故事。剧情贴近真实的社会背景，既有现实生活中普通人的希望和追求，也有他们的焦虑和苦恼。在快速发展的工业化、城市化进程中，中国的城市和农村发生了翻天覆地的变化，也随之出现了很多新的社会问题。故事中许多社会现实背景，包括城市教育问题带来的普遍焦虑、自然缺失、乡村教育现状、留守儿童、移动互联网发展、新农村建设等等，都构成了作品中小主人公们的活动场景。剧情内容围绕中国孩子的童年故事，引发孩子和大人的情感共鸣。人们的日子过得越来越红火，可是乡村不再平静，不管大人还是孩子，每个人都需要重新适应环境，不断成长。
沙夏与桂木华成为了新的一组拍档，并为寻找行踪不明的原始元素回路之一——"雷之携香女"而女装潜入了私立女子学校·翠玲学园。在华的帮助之下，沙夏开始调查起了学园中女学生们的圣乳。但是翠玲学园的"姊妹会"会长·濑田深雪对沙夏起了疑心，向他提出了决斗要求…。
匹里卡星的政权遭到了独裁将军吉尔莫亚（八名信夫 配音）发动的政变，大总统帕比（潘惠子 配音）被迫从匹里卡星逃了出来，误打误撞中降落到了地球。此时，大雄（小原乃梨子 配音）等人正在拍摄电影《宇宙小战争》，意外发现了逃难的帕比，交谈中得知帕比年仅10岁，而8岁就大学毕业了，大家也了解到了他的遭遇，决定帮助他，并同他成了好朋友。吉尔莫亚军队通过小型侦察机找到帕比的行踪，向大雄等人发起了攻击，他们捉了静香做人质。帕比为了不连累大家，最后向叛军投降了。帕比的爱犬胖胖（三ツ矢雄二 配音）通过自己的嗅觉找了帕比的位置，可惜来玩了一步，正好遇上了哆啦A梦等人，大家计划一要救回静香和帕比，一同向皮力卡星出发了，但在未知的星球里又将会有什么样的冒险等待着他们了……
