在500年前，蚩尤欲引入化外毁灭三界，天地存亡旦夕不保，有十五位英雄联以生命为代价，终将蚩尤封印于战神山武神坛，500年后蚩尤破封在即，人间群魔骚动，三界有志之士携手挽救苍生，故事就此开始... ....前世结的缘，今生何以再续？
生化战士面临空前危机,这次他们不仅坠入一连串阴谋与诡计的黑暗之网中,还要面对伙伴背叛的考验,而新登场的敌人更是无比棘手。充满冒险动作的全新故事,华丽炫目的计算机动画场景,将带您再次进入最精彩刺激的生化战士世界。为了建立未来的新家园,六位生化战士必须返回美特吕完成最后的任务,但他们却发现这座昔日繁荣的城市已经笼罩在黑暗之中,空中有千丝万缕的蜘蛛网,成千上万的蜘蛛兽大军在城市中到处横行。当他们正准备对抗蜘蛛兽时,却遭到毒液攻击,并且变身为野兽般的模样,若不实时解毒,将永远变成邪恶的神魔战士。这时他们不仅要对抗蜘蛛兽大军,还要设法拯救被黑暗力量控制的村民,面对重重险恶,高贵的战士们还能坚持"团结,使命,责任"的信念吗?身怀绝技的战士挺身对抗身藏剧毒的敌人,经历这场严酷的考验之后,这些伟大的生化战士将再次开创一页全新的传奇,让他们的英名永远流传。
住在以第七迷宫为中心的城镇，支乡的年轻人阿里巴巴，通过做着车夫的打工逐渐实现着自己攻略迷宫，成为大富翁的梦想。这样的一天，他与为寻找『魔神的金属器』而旅行着的迷之少年，阿拉丁相遇了。阿里巴巴在目睹了潜藏于他所持有的笛中的『乌戈君』的力量后，向阿拉丁提出了共同进行迷宫攻略的邀请。 魔笛MAGI第二季全集动画预定播放内容为原作的大圣母篇。
