他，国民级游戏天外江湖中的传说，全球争霸赛第一人、亿万玩家的精神领袖、第一帮派领导者，鲜衣怒马少年得意之时惨遭背叛，走下神坛逃离游戏世界，从此消失匿迹。 多年后，一个自称来报恩的少年出现了。
在日本这一“怪兽大国”，人们的日常生活遭受着怪兽的无情破坏。 主人公日比野卡夫卡，小时候住的城市遭到破坏，他与青梅竹马亚白米娜做出了“将怪兽全部消灭”的约定。 然而，32岁的卡夫卡梦想破灭，就职于一家怪兽尸体解体公司“怪兽清洁公司”。 相比米娜作为日本防卫队队员而日渐活跃，卡夫卡每天都过着忧郁的生活。 过来打工的市川莱诺告诉他，防卫队的年龄限制将会提高，并劝他去参加入队考试。 于是重新下定决心的卡夫卡，却突然受到神秘生物的侵蚀，身体开始怪兽化，被称为“怪兽8号”。
自从人类的和平与幻想被超大型巨人打破的那天起，艾伦·耶格尔便每天持续着没有尽头的战斗。因为眼睁睁地看着无力抵抗的母亲被巨人吃掉，艾伦发誓要将世间的巨人一只不留地驱逐出去。但是，在严酷的战斗中，艾伦自己也变成了巨人。为了人类的自由，艾伦施展着巨人的力量，并在希娜之墙的史托黑斯区和女巨人发生了激烈的冲突。在这场巨人间的战斗中，艾伦最终胜出了。即便如此，艾伦以及人类的休息时刻也不会到来。下一轮的战斗已经宣告开始。对于逼近罗塞之墙的巨人大群，人类将如何面对？
在每一个角落都被探索完毕的世界中，唯一残留的秘境——大洞穴“阿比斯”。 不知道延续到何方，深不见底的巨大纵向洞穴， 栖息着奇妙奇怪的生物们， 沉眠着现在的人类无法制造的贵重遗物。 “阿比斯”那充满了不可思议的姿态吸引了人们，并驱使人们展开冒险。 如此，多次挑战大洞穴的冒险者们， 陆续得到了“探窟家”的名号。 住在建造于阿比斯边缘的城镇“奥斯”的孤儿莉可， 梦想着有朝一日成为母亲那样伟大的探窟家，并解开阿比斯的谜团。 某天，以母亲莱萨的白笛被发现为契机， 莉可决定潜入阿比斯深处。 被莉可捡到的丧失记忆的机器人雷格， 也为了寻找自己的记忆而决定同行。 莉可在深界四层中了穿弹兽的毒。 救了莉可的，是“生骸”娜娜奇。 娜娜奇也成为两人的同伴，三人的冒险向着波多尔多所在的深界五层进发。 在那里，他们遇到了一位自称为普鲁修卡的女孩子……
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
梦想成为职业球手的小山羊威尔，虽然天生身材矮小，却凭借超凡球技闯入梦寐以求的球队。然而本以为是梦想起点，没想到却是“地狱开局”，这支梦中情队不仅赛绩成绩堪忧，队友还个个都是“人才”。面对来自队友的质疑与对手的嘲讽，他能否用自己的意志点燃球队，带领这支落魄之师创造新的奇迹？
