历经百年的时光，将人类与外侧世界隔开的墙壁。据说那堵墙的另一边是一个从未见过的世界。火焰之水、冰之大地、砂之雪原……记载在书中的，尽是些激发少年探究心的文字。时间流转，现在墙壁被巨人毁坏，人类正一步步接近世界的真相。巨人的真实身份是什么？为何墙壁中会埋着巨人？巨人化的艾伦·耶格尔所持有的“坐标”之力是？以及，希丝特莉亚·雷斯究竟知道这个世界的什么事情？在艾伦等104期兵的加入下，新体制的利威尔班建成了。开始行动后，阻拦在他们面前的，是最强最恶的敌人。
主角·麻生胜是望月博士的助手，由于望月博士正在研制NEO生命体·ZO，麻生胜不幸成为了NEO生命体的实验品，望月博士将蟥虫的因子注入了麻生胜体内！之后麻生胜逃离了研究所，由于不能接受自己的身体所以一直沉睡在深山…… 一天，他突然感觉到望月博士的感应而醒了，原来博士他以改造了一只NEO生命体·杜拉斯，杜拉斯有着比ZO更强大的力量，而且拥有用自己身体的一部分来制作怪人的能力！ 另一方面，杜拉斯正准备捉拿望月博士的儿子·望月宏，皆因博士对宏的爱多于自己，从而使杜拉斯嫉妒不已。但幸运的是，ZO正好出现，并救了宏，与NEO生命体·杜拉斯的连翻激斗也由此开始！
