2014年，讨厌机械的高中生·夏目亮为了改变自己而迈出了那一步。然而，他却死于卡车之下——。然后2030年的东京港湾，潜入了未知兵器“EX-ARM”的交易现场的警察·上园美波与人造人·阿尔玛这一搭档遭到了装备着“EX-ARM”No.08的敌人的袭击。她们为了打破这一绝境，强制启动了从敌人手中夺走的“EX-ARM”No.00……
《赛尔号之圣者逆袭》是《赛尔号》动画片的续集。讲述的是2110年，地球能源已接近枯竭，环境污染日趋严重。 为了实现地外星系探索计划，人类制造了名为赛尔的机器人，并建造能源探索飞船赛尔号，寻找传说中的无尽能源。可就在找到无尽能源的时候，无尽能源被宇宙海盗欧比组织摧毁，赛尔们不得不去寻找藏在宇宙深处，由谱尼看守的第二个无尽能源……
