藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。 《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？ AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了赛车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。
“上帝，世界今天依然健健康康地疯狂着。” 就读于东京都内私立高中的高一学生护郎，既没有“希望”、“梦想”，也没有“野心”。 有一天，护郎的手机收到了奇怪的通知：你被选中了，请说出你的愿望。 在许一个愿望后真实现的护郎面前，一个神秘的女孩拉尔出现了，她对一连串的事情感到混乱的护郎宣告残酷的命运。 护郎被“伟大的意志”选中，为了实现他的愿望，他将与其他神候选人竞争 "神 "的位置，互相残杀，直到只剩下一个。
