真夜中之侦探，讲述的还是关于吸血鬼这个永恒的话题：在百鬼夜行的东京，只有身为吸血鬼的紫藤可以与之对抗。成立侦探社，以侦探之名掩饰身份，与人类共存的紫藤，在同伴布利德出现之后，不堪的往事被慢慢重提…… 紫藤：已活了300年的吸血鬼，开了一家侦探事务所，为保护人类而与夜灵作战。 理保：家人为夜灵所害，在紫藤的侦探事务所打工的少女。 弥生：美丽精干的nos警员，并提供紫藤的食物（血）。 咕哩：一直跟随着紫藤的有着一对翅膀的绿色的小妖精、 夜灵：一种夜间出来的恶魔，种类很多，为了得到光明，千方百计想要获得人类的身体。
科学家本（Zach Galifianakis 饰）隶属于美国政府某个秘密部门，它通过高科技手段训练豚鼠说话与思考，并将它们培养成特工人员。然而，本的部门却面临被FBI关闭的局面，为了证明他和豚鼠特工的能力，本向豚鼠特工队的负责鼠达尔文（山姆·洛克威尔 Sam Rockwell 配音）下令，要它们潜入赛博林工业的CEO罗纳德·赛博（Bill Nighy 饰）的办公室，寻找罗纳德向中东国家出卖可用于军事的高科技芯片的证据。达尔文毫不怠慢，带着布拉斯特（崔西·摩根 Tracy Morgan 配音）、华蕾斯（佩内洛普·克鲁兹 Penélope Cruz 配音）、苍蝇莫奇和斯贝克斯（尼古拉斯·凯奇 Nicolas Cage 配音）等成员迅速展开行动。 这群豚鼠特工队员体型虽小，却身怀绝技，它们成功闯入罗纳德的办公室，并下载到重要资料。然而，这场冒险才刚刚开始……
