作品主角是不太会拿捏与他人之间距离、身材娇小的阿波连同学，以及目标是「交到一百个朋友」、坐在阿波连同学邻座的来堂同学。两人之间的距离以掉在地上的橡皮擦为契机而急速接近，一场青春恋爱喜剧便由此开始。
乡下剑术师范贝里尔·加德南特。 如今，他作为骑士团的特别指导官，同时担任孤儿的监护人，渐渐习惯了在首都的生活。 然而，周围的环境却不允许贝里尔安享太平—— 在钻研魔法的教育机构中。 在耸立着必须逾越的高墙的故乡。 在眺望国境的边境伯爵领。 在阴谋翻涌的异国他乡。 贝里尔将作为一名剑士，作为一个人，迎向那些无可回避的全新战斗——
在死神界有留克的死神追加了讲述月亮的场面。伊出不登场。随着夜神总一郎心脏病发作的场面被删除，他在第二次基拉事件时看电视的地方也从医院的病房变成了街头。月和L的初次见面的地方变更为放映室。L想到了基拉对第二个基拉的回答。松田误入松柏集团会议室时做弥撒的地方，从工作间改到搜查本部的房间。在雷姆消失的场面中，留下雷姆笔记本的描写和月亮拾到笔记本的描写被删除，第三本笔记本的情节全部被省略，与《光环2》相连接。L的墓前，追加了日本搜查本部的成员宣誓的场面。部分干部的死因，从心脏麻痹一律改为个别死因。三堂从建筑物坠落死亡。纸村伫立在车站的铁轨上，被电车轧死。奈南川是交通事故。
新历 0001 年，神明降临入侵，人类文明 15 年后走向灭亡。大夏守护神林凡，竟意外重回神明降临前三月。这一次，他要率领大夏举国抗神！海洋之神、天空之神、凛冬之神…… 皆将在大夏的钢铁长城、巨炮、熔炉前颤抖，看凡人如何逆袭斩神明！
安冈紫音（川澄绫子 配音）有着非常悲惨的童年，双亲惨遭凶手杀害，而年幼的她则成为了唯一的目击证人。因为受到过度的惊吓，紫音失去了说话的能力变成了哑女，住在隔壁的将棋职业棋手安冈信次无法对无家可归的紫音置之不顾，于是收留了她。就这样，紫音来到了安冈家，开始接受将棋训练。 出生于富贵之家的千金大小姐二阶堂纱织（水野理纱 配音）、男扮女装的斋藤步（朴璐美 配音）、温柔善良的久谷彻，在学习将棋的道路上，紫音结识了这些值得信赖的伙伴们。与此同时，紫音也从未放弃过追踪父母死亡的真相，她发誓要将双手沾满鲜血的凶手捉拿归案。
高中三年级的筒井光是所谓的御宅族少年。 只要有游戏或动画里的二次元女生的话，感觉就能独自一人生活了……。 但，他突然被超绝3D（现实）美少女·五十岚色叶告白，并开始和她交往！ 在被奔放的色叶玩弄于股掌之间的同时，筒井逐渐爱上了她……。
