1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
作品主角是不太会拿捏与他人之间距离、身材娇小的阿波连同学，以及目标是「交到一百个朋友」、坐在阿波连同学邻座的来堂同学。两人之间的距离以掉在地上的橡皮擦为契机而急速接近，一场青春恋爱喜剧便由此开始。
曾几何时，一个神秘奇怪的生物（关智一 配音）将月球的70%蒸发掉，并且扬言在次年的3月破坏地球。为了捍卫地球，各国政府出动军队，调派最先进的武器攻击这个可怕的怪物，可是他们用尽了各种办法，却没有起到任何效果。谁知就在恐慌逼近的时候，该生物竟然来到椚丘中学3年E班担任老师，以潮田渚（东山奈央 配音）、赤羽业（冈本信彦 配音）为首的学生们各显其能，试图干掉这个“杀老师”，无奈对方拥有20马赫的速度，杀他几乎成为一件不可能的任务。平静的日子缓缓流淌，学生们丝毫没有放弃暗杀老师的念头。这一天，京都的修学旅行即将举行，少男少女各自组队，准备迎接快乐的时刻，同时策划对“杀老师”进行新一轮的暗杀…… 本片根据松井优征的漫画改编。
