“天才”在被发现后开始塑造其轮廓。此时，天才前锋凪诚士郎的自我正征服世界！！ 把“好麻烦”挂在嘴边的高二学生凪诚士郎，整天过着百无聊赖的日子，直到梦想成为世界杯冠军的同校同学御影玲王发现了他的天赋。在玲王的邀请下开始踢足球的凪，发挥出了超乎想象的足球天赋。某日，他收到了“蓝色禁区”计划的邀请函，等待他的是与洁世一、蜂乐回、糸师凛这些从全国各地精挑细选出来的前锋们的集结。强强激战中，最终，天才凪诚士郎迎来“觉醒”时刻！
巨无霸们押送威震天返回塞博特恩时，威震天逃脱，率先抵达塞博特恩，并完全控制了塞博特恩，击落了巨无霸们的飞船。威震天企图消灭全部有机形态元素，在塞博特恩上撒播病毒，抽取了所有变形金刚的火种，以将其纯化为无机化力量。擎天圣率领小分队顽强抵抗，在圣贤的指引下，激发了塞博特恩内部的有机能源，对抗威震天的机械兵军团（武装兽）。最后，威震天成功收集所有变形金刚的火种并纯化自己，变得异常强大，企图利用魔力神球之钥将塞博坦完全无机化，擎天圣为阻止威震天而与其同归于尽。塞博坦转变为充满绿色的有机星球，擎天圣用生命换来了塞博坦有机与无机的和谐统一。
