在火焰魔女事件之后，莫凡再次投入到魔都学府的修炼中，但就在最关键的时刻，突然传来了好兄弟张小候失踪的消息。重感情的莫凡立即停止赛程，带着魔都血族好友柳茹共同赶赴古都，闯入了正处于妖魔活跃期的中心地带。
ガイラー星的考察队遭遇事故而在地球迫降，迟迟等不到本星救援队的考察队内部终于发生了内乱，过激派ゲルドン夺权称帝，建立ガイラー帝国并准备利用超兵器空爆机器人侵略地球。主和派的ヤン博士为了阻止ゲルドン的野心，将新型空爆机器人“グロイザーX”托付给女儿リタ，并让她将ゲルドン帝王的野心告知地球人。リタ脱出后遇到了特技飞行员海坂譲，两人一同驾驶グロイザーX开始了战斗。
时为近未来，人类的心理状态和性格倾向都变得可测定且数值化。人们把这一测定值俗称为“PSYCHO-PASS”，并以此数值为指标积极地迈向“好的人生”。而犯罪也是通过数值来处理。厚生省公安局的刑警们由拥有高犯罪系数、为犯罪者心理所迫的猎犬“执行官”和拥有冷静的判断力、指挥执行官的精英人物“监视官”组成队伍，以由总括生涯福祉支援系统“西比拉系统”所解析的与犯罪相关的数值“犯罪系数”为依据，守护着都市的治安。他们追捕那些数值超过规定值的、有犯罪危险性的犯罪者“潜在犯”，并利用可以瞬时测定“犯罪系数”的断罪之枪“Dominator”将其处决。监视官常守朱经历了无法正确解析“犯罪系数”的“免罪体质者”槙岛圣护的事件，作为一名刑警逐渐成长，并得知了西比拉系统的真相。她依然信守人性与法律秩序，遵从系统的指示，率领新生的刑事课一系，每天与犯罪者对抗着。然而，足以动摇系统的怪物正在他们面前悄悄潜伏着，而他们却对此一无所知
孤儿女孩凌清捡到了一个弃婴，取名凌风，从此姐弟相依为命。凌风发现自己是玻璃脉，为了保护姐姐加强锻炼，结果意外暴毙。凌风进入了梦境发现自己原来是神武大陆武圣奇才，误饮了封印多年的太一真水，结果惨烈自焚，离奇重生武道变成玻璃脉的废材，醒来发现自己经脉都痊愈了。姐姐凌清患了寒冰魄，必须需要融血丹才能治愈。 为此凌风报考了灵武学院，经过选拔凌风获得选拔第一名，拜入美女炼丹师云梦门下学习炼丹。凌风有炼丹天赋，半个月后就成为了初级炼丹师。凌风体内有太一真水，武功修为成长也很快。学院跟莫云宗交流战，灵武学院弟子被莫云宗
女高中生铃木的个性开朗、交友甚广、擅长察言观色，是班上的中心人物之一，她喜欢的对象是坐在自己隔壁的男同学谷，而谷的个性与铃木恰恰相反，他内敛沉稳、有主见、待人一视同仁。铃木一直无法鼓起勇气告白，直到某日一个偶然机会，两人放学回家时走在同一条路上，并因此牵起了手。之后两人相互倾诉对彼此的好感，并开始交往，而同学们虽然感到讶异，但也都很支持两人的恋情。
遥远未来，世界人口数在迎来巅峰后，开始呈现下降的趋势。人类为了让物种繁荣存续，制作出管理生态系的AI，并执行「人类多样化实验」。常人、兽人、魔族等经过遗传因子改造诞生的「多样人种」，在环绕高壁的生活圈之中，打造出被称作「CLUSTA」的「多样城镇」。有着丰富人口的「CLUSTA」，在各地都有不同的文化发展以及适合在地生活的人类居住。 为了不面临灭绝，人们都在AI的管理下度日──。
在前一作里，邪恶的王后最终受到了正义的惩罚。白雪公主和王子携手步入了婚姻的殿堂，过上了幸福美满的生活。然而，这如同童话一样美好的场面却并不是故事的结局，某一天，白雪公主站在镜子前，发现自己的脸上竟然长出了青春痘，不再拥有美貌的她，还能够留住王子的心吗？ 不仅仅是白雪公主，小矮人、猎人和王子都纷纷站到了他们各自人生的十字路口，是选择利益还是选择忠诚？每个人都有他们不同的见解。接二连三出现的意外并非偶然，而是一心想要复仇的王后和魔镜联手设计的阴谋。拥有着圣剑的骑士现身，他能否成为救世主？
