森永高中由互看不顺眼的“北校区文化生”和“南校区体育生”组成，两校区水火不容。这一年，学校考虑到双方学生的发展，将“文体”两校区合并。这条消息引起了学生们的极度不满。北校区赫赫有名的学习机器袁彩希、学神宁泽宇和南校区的“小霸王”李赫被分到了同一个班级。从此森永高中开启了“易燃易爆炸”的合班新纪元。从“对立”到“理解”少年们共同成长，联手为荣誉和梦想而战。
将江户川乱步作品中的角色怪人二十面相改编成国际骇客集团，以遭受网路犯罪威胁的现代日本为舞台。
邪王石之轩武功盖世，但他害怕自己的一身邪恶武功将来为祸人间，于是将自己和封存住巨大功力的邪帝舍利一起冰封在邪王墓里面。进入邪王墓的唯一钥匙就是记载着上乘武功的秘笈《长生诀》，因此江湖上人人都想得到它，但它已经失落于江湖多年，无人得知它的去向。另一方面，杨州城的两个自幼相依为命的孤儿寇仲（林峰 饰）和徐子陵（吴卓羲 饰）虽然一直在干些小偷小摸维持生计，但二人天资过人，都希望学成一身好武功将来出人投地，于是想拜当地的石龙道长为师。岂料去找石龙的时候，发现石龙正与一武功高强的女子傅君婥相斗。原来石龙从傅君婥身上盗走了江湖上人人欲得之的《长生诀》。一番恶斗后，傅君婥取回了《长生诀》，但也受了重伤，寇仲、徐子陵和她一起逃走。这时，朝廷的禁卫军总共宇文化及率领一干人等前来抢《长生诀》，傅君婥知道三人再一起走的话肯定都跑不掉了，于是将《长生诀》交给寇仲二人保管，然后她独自引开追兵。寇仲、徐子陵这对自称的杨州双龙自此开始了他们的江湖之旅。
众人参加洛根李的葬礼，但洛根李复活归来了。最后的战争开始，朱丹泰出狱，还放狠话说“沈秀莲会死！”
莹莹是一个工作女强人，她在职场上所向披靡，但在爱情方面，却一直不顺利。现在已经38岁的莹莹还没有遇到真爱。直到长相帅气、聪慧机智的实习生琛尼出现在她身旁，让莹莹开始产生了悸动。琛尼本不相信爱情，但遇到莹莹后，他开始慢慢打开心扉，去学习爱一个人的能力。他通过努力和真诚，终于走进了莹莹摇摆不定的内心，但前提条件是他必须将此事保密三个月。因此他不得不瞒着所有人，甚至包括自己的家人。本该开开心心地工作，但现在不得不变得心惊胆战，生怕漏出破绽。琛尼本以为两个人可以顺利的走下去，然而，莹莹又遇见了身份地位更加相配的中年。
这一季对应原著小说第九部和第十部，主人公乌特雷德将夺回祖传领地——贝班堡。
相棒外传『米泽守的事件簿』上映期间播出，2009年3月18日开始每周三发布一回，共4回。出演人物除了第一部的4人外，追加了角田课长。
