全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年—— 拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明—— 从石器时代到现代文明，绝对要赶上这科学史的200万年差距！ 前所未闻的创世冒险谭，就此开幕！
故事主人公本城彰男（松冈祯丞 配音）是一个乐感极好的普通中学生，听过一遍的曲子就能记下来，他暗恋着同班女生树里（上田丽奈 配音），却从来没有机会走进她的世界。两个本属不同圈子的人，被一首奇特的小曲牵引在一起。本城第一次触碰到树里的真实世界，发现了她柔软脆弱的一面。 一个关于人偶少女与人类少年的奇幻梦境，一直困扰着树里，让她深感孤独。而本城，因为那首奇异之曲，也开始梦到了相同的故事。每个人都有自己的世界，本城能否走进树里的真实世界中去？ 本作为日本“动画未来2014”四部参评作品之一，由日本三大独立动画制作人之一的吉浦康裕执导。
Ada Twist 是一位年轻的科学家，他将探索通过科学发现、合作和友谊来帮助人们。
次郎是光明寺博士为了替代死去的儿子一郎而倾尽心血的产物，但是作为一个有自主意识的人造人，次郎的思维装置——良心回路在完成的时候出了问题。人类害怕次郎，因为次郎可以不断学习，最后超越人类；而机器人也讨厌次郎，因为拥有良心回路的机器人更加接近人类。并且，有良心回路的机器人是可以拒绝命令的，这更是让次郎被人类和机器人两边都排斥的原因。 在于基路教授战斗中，次郎一边通过战斗学习促使良心回路成长，一边寻找光明寺博士的下落。这时，自称次郎的弟弟的人造人三郎为了确认自己存在的意义而向次郎发起了挑战，而让次郎无法还手的利用就是，冷酷的基路教授把光明寺博士的脑放在了三郎体内！！
