《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
月下的灵魂被侵蚀，期待的救赎不再， 双眼一睁，所看到，竟是灭绝希望的世界... 中原大祸将起，邪帝正统传人九幽，率领精锐大军来犯，四大执首，洺双、袖权、猊戬、稽咸，各个骁勇善战，配合叶口月人先进的科技，中原武林在素还真、一页书，两大支柱生死不明的情况下，究竟该如何回天？是谁将扛起重任？游离两方，心机沉重的北川炼，要如何掌控局势？ 宫灯帷再次亮起，站在三教顶峰的三人，剑子仙迹、疏楼龙宿双双现身，他们两人如何改变武林的局势？身负使命，走入黑暗世界的佛剑分说，又会如何挽救这难以扭转的未来？ 驱魔人，嗜血者，在月光下响起的乐曲，代表着在中原与叶口大军战的风云变色的同时，真正的危机才慢慢展开。
霓云坊、不羡楼获得了皇上御笔赐名，一时间，沐云瑶的名声响彻金陵。同时，沐云瑶与钺王的心意也逐渐明晰，小生活过得不亦乐乎。此时，新任盐运史李牧年上任，掀起一场针对全城盐政侦查案，沐云瑶也牵涉其中，金陵城中风波再起，两人应该如何携手共渡难关。
