讲述的是一个有关抗争与抉择的故事。能源之光即将消灭殆尽的宇宙，系出同源的光盟与影盟仍因为彼此的理念冲突而争斗。光盟战士叱风云与影盟盗猎团夜旋风察觉到，挽救宇宙的希望就在地球上。双方在地球展开绝体绝命的激战。然而就在这时，叱风云却在无意间发现，这个宇宙秘宝竟来自于光盟内部。它为什么一直被隐瞒?又是由谁将它带到了地球？黑暗正在蔓延，叱风云渐渐发现,自己要面对的，居然正是一直以来所深信的“正义”。战争的硝烟越渐越浓，谁能在这之中，保持自己，做出无悔的选择呢……
主人公小星，只是一名普通的中学生，但他一直在为实现梦想而不懈努力。偶然间，他发现学校的物理老师凤鸣，竟然就是二十年前的天才机械师。经过一番努力，小星与他的伙伴获得了凤鸣老师的帮助，踏上了为了梦想竞赛的旅程。
上古时期妖兽纵横，一位神秘道人分别授予了阴阳五行的特殊能力给金木水火土五个家族来抵抗妖兽，他们将妖兽驱赶到神隐雾山之中，设立结界。 雾山之中另有被封印于巨阙神盾之中的具有强大灵力的麒麟兽，常常吸引来那些想要提升妖力突破结界的妖兽。火行使者闻人翊悬为救其母私自打开了巨阙神盾，小麒麟趁机偷溜出来，妖兽界将掀起一 股腥风血雨......
“夏亚的反叛”的第二次新吉翁战争12年后，宇宙世纪105年（U.C.0105），一个名为“马夫蒂”的反地球联邦组织开始以暗杀政府高官的方式对抗强权统治的地球联邦政府。该组织领导人马夫蒂·纳比尤·艾林的真实身份，是曾与阿姆罗·雷并肩作战的一年英雄布莱特·诺亚之子——哈萨维·诺亚。虽被展现奇异力量的少女琪琪·安达露西亚言语捉弄，但哈萨维仍为实现马夫蒂的目标而步步推进。与此同时，追捕马夫蒂的联邦军大佐凯奈斯·斯雷格收到了刑事警察机构汉德利·约克桑的密约提议。在哈萨维与肯尼斯各自为实现目标而行动时，琪琪亦为履行自己的使命，踏上了前往香港的旅程。
