男主林缺醒来，发现自己身处于一个垃圾桶里，“这是发生什么事了？”起身一看，一个大叔正在角落里尽情挥洒着青春，好奇的林缺走上前去想要问个究竟，谁料大叔突然扭头！“这个大叔不是人！！”张着大嘴的大叔想要袭击林缺；正当林缺极度惊吓摊坐在地准备领便当的时候，一把剪刀阻挡了怪物，劫后余生惊魂未定的林缺突然扭头！发现一个漂亮姐姐站在他的身后，红色瞳孔映出了林缺惊魂未定的面庞，“我叫红叶，这是一个异能的世界，想要生存下去，就必须学会适应！”
生化战士面临空前危机,这次他们不仅坠入一连串阴谋与诡计的黑暗之网中,还要面对伙伴背叛的考验,而新登场的敌人更是无比棘手。充满冒险动作的全新故事,华丽炫目的计算机动画场景,将带您再次进入最精彩刺激的生化战士世界。为了建立未来的新家园,六位生化战士必须返回美特吕完成最后的任务,但他们却发现这座昔日繁荣的城市已经笼罩在黑暗之中,空中有千丝万缕的蜘蛛网,成千上万的蜘蛛兽大军在城市中到处横行。当他们正准备对抗蜘蛛兽时,却遭到毒液攻击,并且变身为野兽般的模样,若不实时解毒,将永远变成邪恶的神魔战士。这时他们不仅要对抗蜘蛛兽大军,还要设法拯救被黑暗力量控制的村民,面对重重险恶,高贵的战士们还能坚持"团结,使命,责任"的信念吗?身怀绝技的战士挺身对抗身藏剧毒的敌人,经历这场严酷的考验之后,这些伟大的生化战士将再次开创一页全新的传奇,让他们的英名永远流传。
同时拥有显赫出身和悲痛过去的卡路尔·阿巴斯（花江夏树 配音），以庶民的身份和无血缘的妹妹艾丽尔（竹达彩奈 配音）登上伊斯拉，前往凯格斯高中飞行科学习。伊斯拉是一座漂浮在半空中的陆地，由巴雷特洛斯共和国等三个国家共同管理。在动力的驱动下，伊斯拉开启了遥远的征程，前往传说中的圣泉寻找“天空的尽头”。然而仅有极少数领导层成员知道，伊斯拉此行还有另一个不可告人的使命。卡路尔偶然邂逅了贵族女孩克莉亚·库鲁斯（悠木碧 配音），他们彼此互生好感，并结成飞行训练搭档，但卡路尔却不知晓他和这个女孩有着怎样痛苦的孽缘。满怀理想的少男少女遨游长空，等待他们的是何等严酷的命运…… 本片根据犬村小六（小说）、森泽晴行（插画）创作的轻小说改编。
