表面上是优等生，气质高雅、深宅的令嬢，给人一种难以接近的氛围的和田。金发、晒黑的皮肤，外貌像是“辣妹”一般，因此被周围人畏惧的山本。她们分别就读不同的学校，独自度过每一天。而只有在每天放学后，她们在食品广场相遇时，才会展现出只属于彼此的表情。
故事以江户时代后期为舞台，最强死刑犯忍者「画眉丸」为了能再次与最爱的妻子见面，与处刑人「山田浅右卫门佐切」一同前往被称为极乐净土的小岛，找寻「不老不死的仙药」以换取无罪释放，并在岛上与神秘的怪物以及其他死刑犯互相残杀。
被“母亲病危”的消息骗到海外的高中生海棠晴，在那里突然被介绍认识了是“你的弟弟！”的名叫海棠零的男孩子。
海棠晴拼命地照料着谁的话都不听的野生儿海棠零，而海棠零的身世似乎也是一个秘密，加之，在海棠零终于能开始亲近自己时，一场悲剧发生在海棠晴身上。
5年后，与长大了的海棠零再会的晴又将面临怎样的生活呢？
