2006年7月にPlayStation2用ゲームソフトとして発売され人気を博した「ペルソナ3」の劇場版アニメーション。1日と1日の狭間に存在する「影時間」に出現する異形の怪物「シャドウ」。彼らに対抗できるのは、「ペルソナ」と呼ばれる特殊能力を持つ者たちだけだった。私立月光館学園に転校してきた結城理はペルソナの力に目覚め、同じペルソナ使いたちで構成される特別課外活動部に引き入れられる。しかし、部員たちはそれぞれの理由で影時間の真相を追う中、想像を絶する運命と対峙することになる。
冈山乡下出身的樱衣乃为了成为偶像而来到东京，原本憧憬大都会生活的话来到的却是也如同乡下的东小金井。在这里她同一间事务所的没人气的童星‧关野露子，没人气的音乐家‧贯井羽优以及没人气的模特儿‧前原仁菜组成了偶像团体「水果塔」，但是立刻就面临了宿舍即将拆除的危机，为了拯救宿舍她们决定挑战经纪人‧梶野穗步拿来的企划『满溢的水果塔』
在距离现代不久的未来，由於科技的进步，人类赖以代步的汽车早已完全被电动车所取代，每部车辆皆强制配备AI（人工智慧）自动驾驶的功能，配合著都市电脑交通管制系统，车祸事故与交通混乱的现象似乎都不再发生了……。 某日，某辆人工智慧车突然发生暴冲的现象，完全不接受交通中心电脑的管制在路上横冲直撞，理沙与罗娜二位妙龄少女受命驾驶一辆旧型的手排跑车急赴现场救援，二人凭藉绝佳的默契与高超的驾驶技术，终於制伏暴冲车辆挽救三名乘客的性 命，然而灾难并未因此结束，另一个地点又发生不明原因的暴冲事件，这一切的背後似乎隐藏著不为人知的秘密……
