由于两位假面骑士的活跃，邪恶组织·杰鲁修卡被消灭，但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动，而受到该邪恶组织的追杀，之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造，但二人知道改造人的悲哀，而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机，志郎舍命相救，被机关所伤而奄奄一息，为了救他一命，1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。
故事发生于封神大战后。姜子牙率领众神伐纣，赢得封神大战胜利，以为可以唤回世间安宁。然而，一切并未结束。一个偶然，姜子牙发现了原来“封神大战”之下酝酿着更大的阴谋。姜子牙开始踏上探寻真相的旅途......
六千年前，魔神皇枫秀与七十二根魔神柱从天而降，所有生物沾染魔神柱散发的气息，立刻会变异成魔族生物，人类随之进入黑暗年代。随后，人类强者自行组织六大圣殿，阻挡魔族前进的脚步，逐渐形成人魔共存的局面。 主角龙皓晨，为救母加入六大圣殿之一的骑士圣殿成为一名骑士，在一步步成长冒险中，奇遇，诡计，命运般的爱情与友情不断在他身上上演。龙皓晨坚守骑士精神，通过自己的人格与努力，赢得他人认可。他先是与六大圣殿其他天才少年组成“1号猎魔团”对抗魔族，为人类的生存与尊严奋战。同时不惜献出生命，守护自己的伙伴与最珍贵的爱人。而世界的局势变化难测，更多的阴谋在酝酿，更深的秘密也等着他却揭开。 而最终龙皓晨是否能赢得神印王座的认可，登上骑士圣殿的最高荣耀，同时他又是否能面对所有真相揭开的那一刻，化解整个世界最大的危机，一切都有待揭晓。
嘿，兄弟！还记得那些网吧激情燃烧的岁月吗！那些吃着泡面占领A平台放包炸地图的日子！且看枪战世界的相逢与交锋，久违的组队与射击交战，是不是也让你想起当年风华正茂的青春岁月？ 兄弟！What are you waiting for。
当还是很和平的时候，世界突然出现了一个企图侵略地球的邪恶军团“黑暗十字军”，地球受到无尽的威胁。在这时，联合国组成了一支地球保卫联盟的军队。这支军队被分配到不同角落，其中一支就处于日本。“黑暗十字军”开始在日本不同地区破坏。 日本各地，黑暗十字军各自选出目标，杀害反对他们的人。当大家都被杀害，其中五人奇迹生还并发誓会复仇。他们穿上特别的电子战衣，使用着普通人没法使用的超能力。指挥官告诉他们，他们是秘密的战士·“秘密战队五连者”。具有很好的机会去对抗十字军。
