此為TV版動畫第三部，從1997年4月4日至1997年9月26日放映，全26話。 此作完全脫離原作，為動畫原創故事，原創的角色也很多。由於是動畫原創，部分設定和原作設定相矛盾，並且原本的主角：莉娜等人的存在變成了半個旁觀者。故事走向太過於沉重路線，和原作原本的作風相距甚遠，所以沒有受到與前二作相等的評價。
三年之约后，萧炎终于在迦南学院见到了薰儿，此后他广交挚友并成立磐门；为继续提升实力以三上云岚宗为父复仇，他以身犯险深入天焚炼气塔吞噬陨落心炎……
故事发生在21世纪的凤天市，讲述主人公安小武、元飞飞、白羽、周豪、金昊、陈默等人的战卡机因意外导入R程式程序而被激活，由此开始了风靡全国的关卡战馆比赛。在越来越激烈的战馆通关过程中，反派BOSS黑战神的野心逐渐浮出水面，小武等人通过智慧、团队合作、勇气、自信，一步步克服困难，最终战胜了黑战神，守护了战卡世界和大家的梦想。
