POLYPHONICA是一个被称为“精灵”的生命也存在的异世界。与地球上存在的世界同属于平行世界，从地球被POLYPHONICA大陆传唤的人类也在这个世界生活。POLYPHONICA大陆的科学水平是地球的现代～近未来的水准，与地球现代科学产物同样的东西也基本存在以外，所谓的未来城市也一样存在。与之平行的是，借助演奏“神曲”的精灵力量这样的技术体系也同时发展着。似乎在这个世界隐藏着极大的秘密，精灵和人类不知不觉就面临着真相揭晓的那个时候……
佳纪和光住在乡下小村庄，两人一起长大，从小形影不离。 燠热难当的艳阳。 此起彼落的蝉鸣。 回家路上的冰淇淋。 那天，一个再完美不过的平凡夏日，他们随口闲聊，哈哈大笑。 佳纪忽然转头问光：“其实你不是光吧？” 六个月前，光在山里走失，一星期后离奇归来。 这个光的容貌和言语都与原本的光别无二致，但他体内有某种不太对劲的东西在骚动。 “光已经不在了，那样的话，你……” 佳纪继续与那个模仿光的“东西”相处，假装一切都没有改变。 然而，村庄里却开始怪事频传。 渐渐坠入某个未知的“东西”…… 以成长为主题的恐怖故事拉开序幕。
原本是现代日本的社会人，转生到剑与魔法的「女性向游戏」世界而成为名叫里昂的人物，对于那个女尊男卑的世界感到绝望。在这个世界之中，男性如同负责提供女性生活所需的家畜。能够算得上例外的，大概就只有身为游戏攻略对象的王太子，以及他身边的型男军团。对于这种蛮横不讲理的处境，里昂拥有一个武器──前世受到嚣张的妹妹要胁，不得不攻略这款游戏时所累积下来的相关知识。在因缘际会之下，里昂只好运用这些知识，挺身对抗诸多任性妄为的女性与型男。
为求仙药线索，一行人抵达统治岛屿的怪物"天仙"之居城。 欲从岛屿生还，死囚与处刑人已不得不携手合作。 与此同时，幕府以"山田浅卫门殊现"为首，下令增派人员登陆神仙乡。 其中竟可见与画眉丸素有渊源的石隐众之身影。 正当画眉丸等人欲尽快寻得仙药逃离孤岛之际，天仙们却拦住了他们的去路—— 围绕仙药的争夺，即将迎来"人类"与"天仙"的全面对决——！！
公园的滑梯前，传来了儿童略显孤独诡异的童谣，阴森可怖的《暗芝居》再度上演。 进入空无一人浴池内洗澡的青年，遭遇隔壁浴室不断借各种物件的女人；两个迷路的人夜晚开车，在藏着可怕生物的隧道内抛锚；情侣搬到便宜的公寓，这里却有讨厌的老鼠；某病人半夜惊醒，他发现医院内有一处格外热闹的病房；诡异的标本博物馆，有着另人意想不到的藏品；热闹的庙会上，两个女孩不小心进入一个诡异的庙会现场；三个集训的男孩挑灯夜聊，其中一人讲起了他最近的噩梦；年轻人潜入鬼宅探险，见到了苍白的女儿节玩偶；一所中学内，流传着会把人捏碎的握手大叔的传说。 恐怖的故事接二连三，请一定坐稳，不要走开……
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爸爸是英雄，妈妈是精灵王，艾莲拥有专属于科学家的独特技能——根据自己的喜好来改变物质的结构与合成。 在爸爸、妈妈与精灵们的宠爱下，艾莲幸福成长，却在和爸爸造访人间之际被国王盯上，全家人陷入危机？ 人类和精灵200百年前的纠葛重新被提起，两族似乎永远无法重归于好…… 诅咒再一次降临人界，无数无辜人民受害。精灵艾莲决定，运用知识和力量，守护人类也守护家人。
