电视剧版《功夫熊猫》集中讲述了熊猫阿宝在成为“神龙大侠”不久后又面对的重重艰难考验，剧情将填补两部电影版《功夫熊猫》之间的空隙，人物设定将沿用电影版，“中国元素”仍将成为其亮点。此外，电视剧版《功夫熊猫》中将出现不少新角色，“他们大都是反派，功夫盖世，对阿宝造成不小的威胁。”
故事发生在小嗝嗝与没牙仔分开的五年之后，博克岛一年一度的亲衣节又到了，然而随着小嗝嗝的孩子们的长大，对龙与人曾经那段真挚而深刻的友谊只能通过父母的言语来了解，不免产生了质疑，小嗝嗝为防止孩子们对龙的误解，又能想出怎样的妙招呢？
月下的灵魂被侵蚀，期待的救赎不再， 双眼一睁，所看到，竟是灭绝希望的世界... 中原大祸将起，邪帝正统传人九幽，率领精锐大军来犯，四大执首，洺双、袖权、猊戬、稽咸，各个骁勇善战，配合叶口月人先进的科技，中原武林在素还真、一页书，两大支柱生死不明的情况下，究竟该如何回天？是谁将扛起重任？游离两方，心机沉重的北川炼，要如何掌控局势？ 宫灯帷再次亮起，站在三教顶峰的三人，剑子仙迹、疏楼龙宿双双现身，他们两人如何改变武林的局势？身负使命，走入黑暗世界的佛剑分说，又会如何挽救这难以扭转的未来？ 驱魔人，嗜血者，在月光下响起的乐曲，代表着在中原与叶口大军战的风云变色的同时，真正的危机才慢慢展开。
某天，独居在森林里的魔女艾丽莎（声优：古贺葵）捡到了人类婴儿。艾丽莎替婴儿取名为「薇奥拉」，并决定扶养她。十六年后，薇奥拉（声优：水树奈奈）不只变成超级恋母的女孩，连个子和上围成长的幅度都超乎预料…
天赋超群的习武者李阎由于身患绝症，只剩下几个月的生命。他在身陷绝境时意外遇到了一个自称“貘”的男人，被送入“阎浮果树”的一颗果实中。李阎必须在时限内完成系统发布的三个任务，并通过拳赛赚钱换取阎浮点数以购买能够治愈绝症的药剂。随着深入了解自己所在的龙渊城寨，李阎被逐渐卷入城寨内的争端，还察觉到有其他阎浮行走在暗中与自己竞争。突破重重困难后，李阎终于成功完成任务，也获得了新生。
