二十一世纪，骑士正存在于现代世界。在中世纪欧洲诞生的骑士团大多数被卷入近代化和国家之间的纠纷由此消失，至此现在仅剩下了唯一的骑士组织。 那便是——现世骑士团。 从骑士团溜走的花房叶太郎，徘徊于市镇之际偶遇只身一人的少女·鬼堂院真绪。见孤身生活的真绪，叶太郎决心在身边守护着她。但那样的叶太拥有谁也不曾知晓的另一重身份，那便是《假面的骑士·KnightLance》。 KnightLance因为某些事而隐..
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。
故事将衔接TV版第三季结局紫悦(Twilight Sparkle)进化为天角兽(Alicorn)加冕成新公主之后的生活，此时水晶帝国的珍贵王冠被偷窃；为了寻回王冠，紫悦公主将接下重责大任，独自前往另一
