時瀬高中箏曲社面臨廢社危機。變成孤身一人的社長身邊，突然來了一位不良少年及其友人，緊接著還有一位古箏天才少女。各自不同的古箏之音，編織出一曲青春學園物語―
露西亚，来自北太平洋的美人鱼公主，登陆寻找她七年前由海中拯救的男孩，当时这位男孩溺水了，她用粉红色的真珠救了他一命，并且把她最珍贵的粉红色珍珠交给那位男孩。七年后她为了继承一事来到了陆地去寻找以前的男孩要回真珠，最终找到了那个男孩，名叫堂本海斗，但是化身成人形的露西亚，名叫七海露西亚的女孩，与她的人鱼型态并不相似；她也不能告诉海斗她真正的身份，否则她将变成泡沫。因此她努力的让海斗去想出她的真正身份。 与此同时，露西亚知道有一群水妖已经入侵海上世界。她必须聚集七位美人鱼公主和她们的真珠，使得传说中的海洋女神阿克安·雷芝娜女神复活，并阻止水妖们的阴谋。为了这样，她与另外六位来到陆地的美人鱼公主波音、莉娜、香莲、诺爱儿、可可和沙罗联手，使用她们的珍珠变成歌唱偶像，以她们的歌声作为攻击武器去对付水妖。
牙鬼との激闘から2年、それぞれの夢に向かって旅立った6人は好天の三回忌をきっかけに再び忍術道場に集まった。そこへ突如現れた牙鬼の残党を相手にお互い成長した姿を見せ合うように妖怪を倒していく天晴達。中でもガシャドクロを生身で倒してしまう風花と霞の成長に驚く一同。なんとこの2年、2人は強さと人気を兼ね備えたアイドル忍者“ニンニンガールズ"として平和を守っていたのだった! 戦いを終え久々の再会を喜ぶ6人の前に「久しぶりね天晴」とまさかの人物、天晴と風花の母・桜子が現れた。しかも風花と霞を誘い“ニンニンガールズ"をプロデュースしているというのだ。さらに世界進出を考える桜子から“伊賀崎流"の名前をかけて“ニンニンガールズ"と真剣勝負を提案される天晴、八雲、凪、キンジの4人は“ニンニンボーイズ"として受けて立つこととなった。この試合もアピールの場として使おうとする桜子は、新メンバー・九重ルナの加入をサプライズ発表。さらにミドニンジャーシュリケンを勝手に与える暴走っぷり。そして数合わせとして旋風も加わり4対4の真剣勝負が始まった。 時を同じくして、執念の復活を遂げた有明の方が萬月の復活と、真剣勝負を利用したニンニンジャーの分裂を企て暗躍を開始する――。 果たしてニンニンジャーは再び世界の平和を守ることが出来るのか! ?
