从前有位“光之巨人”，他负责保卫世界和平，对抗巨型怪物和外星人入侵的威胁。他就是机动奥特曼。他曾在执行任务时与科学考察队员早田进建立起联系，并在使命完成后离开了地球。时至今日，人类已进入了繁荣时代，但这只不过是和平的假象...现在，世界再次需要“光之巨人”的力量。就在这时，一个新的英雄出现了，他继承了光的基因。但是他并不高大，是一名中等身材、多愁善感的高中生，穿着金属动力制服。他的名字叫早田进次郎，是初代机动奥特曼早田进的儿子。早田进次郎克服种种困难成为新一代机动奥特曼，一个新的故事就此展开。
沉睡万年的辰南从神魔陵园醒来，在经历了一系列奇遇后名动四方。随着辰南来到央锦国遇到晨曦，新的冒险再次开启，在开元城大战、到死亡绝地寻找身世之谜、大战凌家只为求一个公正清明。在这一季，辰南会在探寻身世之谜的冒险当中不断搜寻雨馨的踪迹。
被“母亲病危”的消息骗到海外的高中生海棠晴，在那里突然被介绍认识了是“你的弟弟！”的名叫海棠零的男孩子。 海棠晴拼命地照料着谁的话都不听的野生儿海棠零，而海棠零的身世似乎也是一个秘密，加之，在海棠零终于能开始亲近自己时，一场悲剧发生在海棠晴身上。 5年后，与长大了的海棠零再会的晴又将面临怎样的生活呢？
