主要讲述了喜欢魔术的高中生黑羽快斗，在自己房间内一道隐藏的门后的密室里发现了世界闻名的大盗怪盗基德的服装。之后，身着怪盗基德服装的快斗遇见了父亲——世界知名的魔术家黑羽盗一以前的助手寺井黄之助，从他的口中得知自己的父亲正是怪盗基德，而且他并非死于意外，而是被人暗杀。为了找出杀害父亲的人，快斗决定以第二代怪盗基德的身份开始着手调查父亲真正死因。在以怪盗基德的身份活动的某日，快斗与称呼自己为“黑羽盗一”的神秘组织相遇，而该组织正是他的杀父仇人，故事也由此正式拉开帷幕。
为苍生大义，白小纯不得不与通天道人展开决战。随着旧世界破碎，众人流落天外的永恒大陆。而在这里白小纯将面对更严峻的挑战，更强大的敌人……
一场全球性地质灾难使得大陆处于割据状态，由不同的武装集团占领。大陆相对繁荣的萨科城被优人军阀攻占，萨科城北部为北域，西部为西庭，还有其周边五大城市原住民联合组织的五城联军，多方各自为政。由贺将带领的东邦小队与优人正面对抗，引起了多地势力的注意。与此同时，各地冲突不断升级，贺将被迫卷入激烈的斗争中。
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
千年前，灵兽蜃与玄水祭司萤情同姐弟，然而蜃顽劣之极，误入魔道，以至生灵涂炭。萤为救天下苍生与汐族协力将蜃魔哄骗封印。封印之时，萤一念之仁，为蜃魔留下一线生机。此后，萤牺牲自己以赎罪，汐族众人也被困于凝固的时间之中。千年后，蜃魔复苏之日渐近，当年的萤转世为玄水祭司瞳溟。蜃魔沉睡千年，只为报复萤的背叛，他附身在了瞳溟深爱的妹妹瞳洸身上，借瞳洸之手毁灭了瞳溟所守护的一切，爱的守护和恨的利刃将会牵扯出怎样的恩怨情仇……
这世上存在着一个选择将法律无法制裁的此世之恶作为恶性肿瘤“去除”，并将其埋葬于黑暗中的秘密组织，其名为“黑色标签”。17岁的高中生·三神岚，作为组织的一员，面对巨大的罪恶挺身而出。这个故事，是以高中生之身担当处刑人的少年，与选择和觉悟斗争的记录。
