小时候搬来这个海滨城镇的由坂健次，眼里看到的，是一望无际的大海被日光照射后呈现的那一片玻子汽水般的色彩。健次在那海边同一位少女相遇。少女的名字叫做近卫七海，就住在健次新家的隔壁，窗对窗仅有1、2米伸手可及的距离。 四季转变，时光飞逝。他们两人的回忆和一起度过的岁月一起渐渐堆积。一如既往的每一天，自然而然的情感，对他们来说，这些就是如同宝物一般。日光渐渐刺眼，蝉叫依稀可辨，天空愈发湛蓝……今年的夏天也来了，对健次和七海来说平常却又有些许改变的夏天……
2011 年，美国佛罗里达州。空条徐伦和她的爱人开车时发生了意外，她掉进了一个陷阱，被判在最高戒备的国家监狱绿海豚街监狱（又名“水族馆”）服刑 15 年。在绝望的边缘，她从父亲那里收到了一个吊坠，唤醒了她内心深处的神秘力量。“这个世界上有比死亡更可怕的事情，而在这座监狱里发生的事情绝对是其中之一。”出现在徐伦面前的神秘男孩向她传达了这条信息，令人费解的事件接连发生，父亲探监时告诉了她这一可怕的真相，以及“迪奥”这个名字……徐伦最终能否走出这座被称为监狱的石之海？最终对决拉开帷幕，乔斯达家族和迪奥长达百年的宿命对决即将结束！！
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
从各个方面看来，就读于白城学院高中部的绫濑裕人（羽多野涉 配音）都是一个极其普通的男生。长相普通、成绩普通、运动普通，甚至于对女孩子的品味也很普通。因此，当同班同学兼校园偶像的超完美大小姐乃木板春香（能登麻美子 配音）出现在他的面前时，裕人并未被春香的魅力所折服，正相反，他觉得这个各方面都十分优秀的女生总是有种说不出的怪异。 裕人的直觉十分敏锐，在一次偶然中，他发现了春香的秘密。原来，这个外表高贵的千金居然是一个不折不扣的御宅族，而春香和她那一拨古怪的朋友们的兴趣，居然是制作魔法少女相关的同人作品！这个秘密迅速拉近了春香和裕人之间的距离，也开启了属于他们的浪漫情缘。
番外3——那些为了中午便当的事
