魔晶学院近在咫尺，千瑞，御风和乌拉拉却被挡在了门外。失落的大家遇到了学长吉吉特，在吉吉特的帮助下，千瑞他们认识了绿色学院的长老天劫，还阴差阳错的获得了考试资格。大家一路过关斩将，顺利通过了五大长老严苛的考试，终于成为了魔晶学院的学生！然而当初答应天劫长老的要求，却让大家惹祸上身，一场大战在所难免。而魔晶学院16年前的秘密也逐渐被揭开。
故事发生在公元1612年，宝嘉公主（艾琳·贝达 Irene Bedard 配音）跟随着英国外交官拉尔夫（比利·赞恩 Billy Zane 配音）远渡重洋来到英国伦敦面见国王和王后，共同商讨族人的命运和领土的未来，跟随着她的除了保镖乌塔外，还有古灵精怪的米可（约翰·卡西尔 John Kassir 配音）、帕西和福利特（弗兰克·维尔克 Frank Welker 配音）。 在伦敦，宝嘉公主意外的和贪婪邪恶的伯克利（大卫·奥根·斯提尔斯 David Ogden Stiers 配音）重逢了，后者再一次将触角伸向了印第安人的土地，想要借此大捞一笔。宝嘉公主识破了伯克利的阴谋，和其斗智斗勇。除此之外，宝嘉公主还遇见了阔别已久的约翰史密斯（Donal Gibson 配音）。
《神兽金刚2天神地兽》是一部具有浓郁中国特色的原创国产动画。它以中国文化为背景,大量运用中国传统神话与经典著作《山海经》中的奇山异兽,充分表现神话人物性格特征,展现了中国悠久灿烂的文化和五千年文明历史,众多新元素的加入为全片增添了奇异瑰丽的中国色彩。故事讲述了用爱和正义遏制邪恶,邪不胜正的故事,告诉孩子们,爱和正义是不可战胜的,秉着寓教育于乐趣中的理念。
