埼玉县，新越谷高校。这年春天入学的武田咏深，在那里与儿时好友的山崎珠姬重逢。中学时代，由于没有捕手能接住咏深的球，因此她那激烈变化的“魔球”无法投出，于是中途放弃了棒球。但在强豪队伍中磨练了实力的珠姬，成功地接下了咏深的变化球。实现了幼时的约定，再次相遇的两人，与同班的川口姐妹及其他同伴们一起让停止活动中的棒球部复活。目标是全国！新生·新越谷高校棒球部的挑战从这里开始——
King Sombra曾经统治小马国边缘的水晶王国，带来了无尽的苦难。后来他被塞拉斯迪亚公主和露娜公主联合击败，变成阴影，并被放逐。 一千年后，King Sombra卷土重来，想要重新统治水晶王国。大公主希望暮光闪闪一行去保护水晶王国，免受King Sombra的再度袭击。他们克服重重困难和阻挠，去保护水晶王国，并让那里再度恢复生机。
世界著名的機械工學者葉山博士，連同大兒子譲治、次子竜治，為最年少的三弟健治舉辦生日會時，三人就在途中被達達星人捕捉了。 後來達達星人派遣機械人軍團侵略地球，此時由宇宙來了兩個機械人。他們就是移植了譲治及竜治所有性格記憶的天地雙龍。此兩個等於親生兄長的機械人，就開始為地球作戰了。
