《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
本片是迪士尼第36部经典动画《花木兰》衍生剧情，当花木兰（温明娜 配音）和李翔准备完婚之际，他们却突然接到一份密旨：为了抵抗强大的匈奴，护送三位公主下嫁和番，维持边疆和平。于是他们立即启程动身，插科打诨的木须龙和蟋蟀当然也一起跟来。但是在途中木兰发现公主们其实不愿外嫁异族，更糟糕的是居然还爱上了别人，这别人正是上次立功而久久被别的女孩拒绝的三个护卫。一向崇尚女子自由意志的木兰，因此决定冒杀头大罪的危险帮助公主逃跑，已经都快到番邦边境，所护驾的公主们却失踪，这样的发展实在超出李翔的意料之外，更出乎意料的是，木须竟然为了自己的权益而挑拨木兰和李翔的关系。在路上，李翔出现意外，为了救木兰而坠下深谷，木兰将会怎么完成自己的任务和拯救自己的心上人呢……
