故事的舞台在现代的东京。在这个世界中魔法使的存在被认为是很普通的事情。只要通过正式的办理手续，谁都可以成为拥有魔法的魔法使。虽然如此，但它和我们所住的世界还是没什么区别的。电视、移动电话、电脑这些东西也都有，汽车也是靠汽油开动的.为了营造画面真实感，片中的场景就像建筑广告，而熙来攘往的人群、电车，都与现实世界无二
在一个星空璀璨的空间里，有一只名叫茉莉的小怪物。她有一个好朋友，名叫艾迪森，是一个发条玩具。他很喜欢跟茉莉一起玩，所以当茉莉将所有的精力转移到别的什么上面的时候，他开始表现出强烈的不满。小茉莉正在织一个红色的帽子，打算送给自己未出世的弟弟，很快，茉莉的弟弟被生出来了，但是那仅仅是一个魔蛋，那个蛋需要去蛋岛孵化才能顺利生出小怪物，于是一家人开始准备着出发启程去魔岛。 在一个星空璀璨的空间里，有一只名叫茉莉的小怪物。她有一个好朋友，名叫艾迪森，是一个发条玩具。他很喜欢跟茉莉一起玩，所以当茉莉将所有的精力转移到别的什么上面的时候，他开始表现出强烈的不满。小茉莉正在织一个红色的帽子，打算送给自己未出世的弟弟，很快，茉莉的弟弟被生出来了，但是那仅仅是一个魔蛋，那个蛋需要去蛋岛孵化才能顺利生出小怪物，于是一家人开始准备着出发启程去魔岛。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。 在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。 而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案，都在「Link Vrains」中
幽冥殿之主，龙国最强人物夜修罗：贺云霆，机缘巧合之下重回故土云州。在所有人都以为他还只是贺家弃子、林家废婿时，他早已隐忍布局好了一切。亡母之恨、凌辱之仇，他发誓要寻回一个公道，势必要让所有迫害他的人血债血偿。
