女孩凯莉亚在父亲工作的油棕园救出一只小婆罗洲猩猩；同时，开发商大举侵占丛林，使原住民流离失所，凯莉亚的表弟也为避祸前来同住。在一次争执后，表弟带着小猩猩负气离开，为了找回家人，凯莉亚决定冒险进入丛林。但在深处等待她的，不只有未知的危险与挑战、被都市人淡忘的信仰与习俗，还有家族中一段从未被揭开的记忆。
时空之隙开启，书院众人来到了现代课堂，新课堂新老师新朋友，可爱的小伙伴们又会产生什么样有趣的故事呢？航天知识的小剧场即将开讲啦！敲黑板！记得认真听课，科学小记者们还有很多小知识要传授给大家哦！！
作品以日本著名推理小说家江户川乱步的诸多名作为原案，将乱步的幻想世界观与现代的舞台相结合。动画讲述在某所中学发生了教师被杀事件。就读于这所学校的少年小林，与前来搜查事件的天才侦探明智相遇。对于只搜查异常犯罪的明智感兴趣的小林，不顾朋友羽柴的反对，自愿成为其“助手”。在接连发生的奇怪事件当中，小林很快和明智展开了调查。
タイトルには魔法少女とあるが魔法少女アニメではなく、魔法少女であるくるみが敵と戦う様子をただ傍観している男子中学生3人を主人公としたギャグアニメである。公式のジャンルは「魔法少女傍観系ギャグアニメ」。 アニメ本編は隔週で配信されており、本編の翌週には声優陣によるオーディオコメンタリー番組「せいぜいがんばれ！魔法少女くるみの中の人」を10分枠で配信。
