故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，一名外星人意外从宇宙坠落，他手持有着象征身份的红色宇宙回旋镖“奥美迦头镖”，并有着“究极”的称号。 失去过往记忆的外星人 “奥美迦” 化身为地球人模样，被人称为“宙人”。初到地球的宙人，对人类充满好奇，积极主动地接触和了解这些陌生的生命体。 当神秘巨型生物接连出现时，尘封的记忆碎片被唤醒，宙人认出这些生物正是记忆中的 “怪兽”。面对怪兽的威胁，强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼，与怪兽展开战斗。 与此同时，地球上的人类对突然现身的巨型生物，以及手持红色头镖与之战斗的巨人充满疑惑。为探寻真相，人类开始从各个角度观察这位神秘巨人。随着故事推进，来自外星的宙人与一位普通青年逐渐成为并肩作战的伙伴。作品将通过他们之间的羁绊与经历，深度探索 “奥特曼为何要守护地球” 这一问题的答案。 现在正是觉醒之时。
充满青春朝气的圣条学院，自初中时代便与井上心叶（入野自由 配音）相识，并因某个事件偷偷喜欢上这名有着温暖和善笑容男孩的琴吹七濑（水树奈奈 配音），也许正是青春的傲骄性格，在同学的追问下，七濑宣言最最讨厌心叶。事后她深感后悔，在好友小森（下田麻美 配音）的鼓励和谋划下，七濑尝试用各种办法表白自己的心迹，可最后不是临阵怯懦，便是弄巧成拙。难道对喜欢的人一展笑容如此困难？少女那充满焦虑和别扭的小情怀。洒满金色余辉的公园，七濑的泪水夺眶而出…… 本片根据野村美月的同名轻小说原作改编。
在仙魔共存之世，桃山大王小桃花因与宿敌打架不慎跌下山头化为原型一束桃枝，却被一个名为长留的俊俏僧人捡回庙中悉心照料。桃花渐渐对长留产生感情，但长留似乎对桃花有所隐瞒，还牵扯到一段不为人知的过去。
