旅行中的奇诺和艾鲁梅斯来到了一个科学高度发达的文明国家。在安定的环境下，该国家人民均生活在巨蛋之内。一方面，这个国家是由杰出人士们创造出来的“开拓地”，然而另一方面，他们又同时渴望着巨蛋之外真实的阳光和土地。
青城山灭派，玄门遭遇旷世劫难。朱离地煞觉醒，携青城掌教冷霜凝险夺玄珠，再顾青玉坛，蒙星象子指点，欲共赴昆仑抵御魔道大军。天一子未赴中秋之约，太白子知道天一子已遇不测，开始查探凶手，本以为是魔道的阴谋，没想到在昆仑派发现了一些端倪。魔道势力风谲云诡，其间隐情扑朔迷离，深不可测的魔道高人邓辰因为太初九元的转世，重出天阴谷，纠集紫衣人等魔道长老集齐三才秘要，欲救出魔道祖师天魔元煞，登顶昆仑之时，幕后黑手阴谋乍现，玄魔两派均遭扫荡。玄魔两派，孰正孰邪，灵飞纪第三季为您揭开面纱。
狐妖蛊惑书生的风波平息后，神都恢复了以往的繁华与喧闹，武后心情大好，决定举办一场盛大的秋猎，邀请王公贵族和民间擅长武艺的能人共聚一堂，切磋骑射。 吐谷浑小可汗慕容纪也受邀参加秋猎，却阴差阳错的成了一场行刺武后阴谋的“嫌疑人”。走投无路的慕容纪只得向裴坤求助，希望他能帮忙找出真凶，洗清自己的冤屈。为保大唐国泰民安，也为帮助好友，裴坤和尉迟柱、韩冬青等伙伴再次联手查案，一路险情和笑料不断，终于追查到了谋刺武后的真凶，阻止了一场大唐与吐谷浑之间的战争。
