电视动画《众神的恶作剧》改编自2013年10月24日发售的同名PSP乙女向恋爱冒险游戏。本作的舞台设立在了各种各样神话中的众神聚集的世界，主要讲述了各神话中的代表神明聚集到这个世界，商量着如何打破众神中存在“讨厌人类的问题儿”这一现状。神明是爱护人类、被人类崇拜的存在，而神明与人类的关系变得稀薄是一件令大家担忧的事。于是为解决这个问题，这个世界里建起了与人类就读的学校十分相似的“校舍”，并选出一名人类少女——草薙结衣来教会这些问题神明何为“人类”、何为“爱”。就这样结衣与神之间的禁断之恋正式开始。
故事发生在名为“风祭”的都市之中，天王寺瑚太朗（森田成一 配音）是一名平凡的高中生，过着风平浪静的生活。一年一度的收获祭即将到来，这个热闹欢快的祭典让整个城市都陷入了欢乐而躁动的海洋之中。 瑚太郎接受了一份寻找新闻线索的工作，于是开始了在城市各处的奔走，在此过程中，只存在于都市传说之中的怪奇事件和神秘生物渐渐浮出了水面，与此同时，瑚太郎的身边亦发生了许多令他百思不得其解的怪事。为此，瑚太郎找到了超自然研究会的会长千里朱音（喜多村英梨 配音），希望后者能够解答他的疑惑，哪知道在两人调查的过程中，瑚太郎的一干好友纷纷被卷入了风暴之中。
林伽林德——这片土地是被墙壁包围起来的世界。墙壁将这片土地覆盖、守护、哺育、培养。墙壁即是神——是这片大地，林伽林德的根基。某天，在林伽林德边境之地「艾泽村」出现了一位神秘男子「巴克·亚罗」。亚罗失去了记忆，却唯独知道自己是「从“墙壁外”来的」。亚罗为了取回记忆而以墙壁之外为目标，却逐渐被卷入围绕着自身的争斗当中——
在这个世界中，存在着一种“中间人”，他们可以吸收自杀者的生命粒子，并利用这些生命粒子延续濒死之人的生命。“中间人”叶晰的搭档尚敏突然失踪，在寻找尚敏的过程中，他发现了自己所处的组织的一些不为人知的黑暗。而这些，都和一个名为“克洛托”的计划有关……
