普通的上班族藤木户健二,他的妻子在忍者斗争中丧命。在他濒死之际,竟然被神祕的忍者灵魂附身了!捡回一命的藤木户,从此成为“忍者终结者”,专门终结忍者,为了复仇而战!以近未来都市新埼玉为舞台,忍者杀手VS忍者的生死决斗揭开序幕.....
故事以史上首个自律人型AI「Vivy」为主角,是以「歌声带给众人幸福」为使命的「歌姬」。某日自称来自100年后的AI「松本(マツモト)」突然出现,并表示自己将与Vivy共同修正历史、避免100年后人类与AI发生战争,使Vivy踏上破坏AI的旅途。
入间和问题儿童班等人课题所经历的新试炼――那就是一年级最终实绩战斗,进入魔界巨大丛林中确保食物的竞技“收获祭”!班级的同伴都互相成为了肉搏战与谋略战的对手!?带着弓展现出凛然表情的入间,以及掌握着入间成长钥匙的新角色「巴巴托斯·拨子」闪亮登场。和问题儿童们站在一起被谜团包围的一年级生「欧若博思·可可」,将在收获祭成为问题儿童们的对手!?少年魔王决定战,收获祭即将开始!!