15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。 有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。 他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。
世界顶级葡萄酒评论家神咲丰多香去世以后，留下了价值20亿日圆的丰厚遗产和一封遗书。在遗书中他宣布，只有以“盲饮”方式猜中他指定的十二瓶顶级葡萄酒（“十二使徒”）以及第十三瓶梦幻之酒（“神之雫”）的酒名和年份，并且将这些葡萄酒的内涵表现出来的人，才能继承遗产。
灵气复苏之后，人人皆具神能，凌云峰修成了无上大能，以一人之力结束了持续500年的战乱，刚刚想要享受一下和平与安宁，突然发现自己无敌之前欠下不少情债，而他该如何处理这些情债，并且继续维持世界的安定呢？
雏见泽是一处坐落在群山环绕之间的僻静村庄，淳朴的民风使得这个古老的村庄一直以来都保留着祖先时代的祭祀习俗，称为绵流。昭和58年的一个夏天，这个村庄迎来了一个新的居民：少年前原圭一（保志总一朗 配音）。新的环境让圭一有些不太能适应，但在结识了温柔的龙宫礼奈（中原麻衣 配音），活泼的园崎魅音（雪野五月 配音），外表孱弱却内心坚强的北条沙都子（金井美香 配音）和古手梨花（田村由里香 配音）后，新的生活很快便如火如荼的展开了。 随着时间的推移，一年一度的绵流祭奠即将开始，然而在此热闹之际，圭一却听闻了一些雏见泽不为人知的过去，以及历年来绵流祭奠所带来的，一人失踪一人死亡的被称为“神隐”的恐怖事件。这些传闻是虚是实？过往单纯快乐的生活是真是假？作为一名“外来者”，前原圭一出人意料的逐渐接近了某个重大事件的真相。
很久以前四处游荡的羽入一族来到雏见泽定居，虽然他们希望能够和当地居民共存，但是在排外心的作用下遭到了拒绝，并发生了流血事件。这时，羽入以人类的姿态和古手神社的神主进行交涉，而且和神主的后继者有了孩子。神主也觉得这样下去不是个办法，于是要求他们遵守几个严厉的条例。而且，为了平定互相猜疑的人心，必须要有牺牲者。羽入接受了这些要求，她甘愿成为古文书所记载的“混沌的鬼神”，倒在了自己的女儿剑下（根据古手家的古文书记载）。而村民们将背负起双方的罪孽和责任，换来了和平共处的“鬼神”奉为了OYASHIROSAMA。当然，羽入并没有这样死去。当她再次复苏的时候，雏见泽已经恢复成了平常的样子，两者和睦共处，而她也在漫长的岁月中默默注视着他们的成长，以OYASHIROSAMA的身份。直到梨花的降临才从寂寞中解放出来。
