《黑子的篮球》故事主要围绕两位主人公——被誉为第六位“奇迹世代”的黑子哲也以及从美国归来的天才篮球选手火神大我展开，两人在球场上市光与影的搭档。相遇后的他们将挑战其他五位“奇迹世代”。
ファンタジー世界を舞台にした国家運営シミュレーションゲーム、『Eternal Nations』。 そこでユーザーランキング一位を獲得した伝説のプレイヤー、伊良拓斗は、入院中に意識を失う。 気が付くと拓斗は、まるでゲームの中のような世界、イドラギィア大陸に降り立っていた――。 そこに現れたのは、『Eternal Nations』で拓斗が最も愛用していたユニット、《汚泥のアトゥ》。 そこで拓斗は、ある決心をする。 「――僕たちの国を作ろう。僕と、君だけの王国を」 アトゥと共に、邪悪な国家である《マイノグーラ》を設立することを決めた拓斗。 個性豊かなダークエルフや英雄を国民とし、 この世界ではチートとも言えるゲームシステムを利用しながら、 大好きな内政に励むのだった。
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故事发生在一座民风淳朴风景秀美的小镇之中，曾经，天空上出现的巨大黑色圆盘令人们陷入了恐慌之中，但除此之外大家的生活却并未受到实质性的影响，世界依旧在照常运转着，久而久之，人们渐渐习惯了被圆盘笼罩的生活。 古宫乃乃香（夏川椎菜 配音）跟随着父亲回到了曾经的故乡圆盘之街，在那里，乃乃香遇见了曾经的玩伴们。个性孤僻沉默寡言的户川汐音（小松未可子 配音）、活泼开朗的看板娘椎原小春（佳村遥 配音）、对圆盘的存在十分反感的水坂柚季（丰崎爱生 配音）和她的哥哥水坂凑太（石川界人 配音），当失落的回忆再度被记起，当告别的朋友们重新相聚，命运的齿轮开始了它的转动。
樱花飞舞的3月25日，完成了一学期学业的午后。高二学生阿良良木历（神谷浩史 配音）从优等生羽川翼（堀江由衣 配音）那里听说了本町出现吸血鬼的传言。当晚，历在地铁站台见到了一个血淋林的女人。她四肢全无，痛苦求救。而女人的身后则站着一个金色头发却目光阴冷的身影，那难道就是传言中的吸血鬼？在这个夜晚，历与活了500年的吸血鬼姬丝秀忒•雅赛劳拉莉昂•刃下心（坂本真绫 配音）完成了命运的相逢…… 本片根据西尾维新的轻小说改编，将以剧场版三部曲的形式上映。
