令和末期，日本因全球核战影响走向衰败，大量难民涌入，更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生，引发民众暴动，国家体制崩溃，人口锐减至原来的十分之一以下，文明水平倒退至明治初期，并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后，大和历56年，生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台，一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
沙夏与桂木华成为了新的一组拍档，并为寻找行踪不明的原始元素回路之一——"雷之携香女"而女装潜入了私立女子学校·翠玲学园。在华的帮助之下，沙夏开始调查起了学园中女学生们的圣乳。但是翠玲学园的"姊妹会"会长·濑田深雪对沙夏起了疑心，向他提出了决斗要求…。
