与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
天赋超群的习武者李阎由于身患绝症，只剩下几个月的生命。他在身陷绝境时意外遇到了一个自称“貘”的男人，被送入“阎浮果树”的一颗果实中。李阎必须在时限内完成系统发布的三个任务，并通过拳赛赚钱换取阎浮点数以购买能够治愈绝症的药剂。随着深入了解自己所在的龙渊城寨，李阎被逐渐卷入城寨内的争端，还察觉到有其他阎浮行走在暗中与自己竞争。突破重重困难后，李阎终于成功完成任务，也获得了新生。
由于一次意外，篮球健将长谷川昂（梶裕贵 配音）所隶属的篮球部被暂停活动一年。失去了最心爱的篮球，小昂的生活开始浑浑噩噩起来。经过阿姨篁美星（伊藤静 配音）的介绍，失意的小昂成为了私立慧心学园小学部的篮球教练。当小学部的篮球教练有什么意思？！虽然心有抵触，但小昂还是上岗了。 经过了一段时间的训练，小昂曾经瞧不起的女子篮球队居然爆发出了惊人的势力。稳重大气的凑智花（花泽香菜 配音），活泼可爱的三沢真帆（井口裕香 配音），个性爽朗的永冢纱季（日笠阳子 配音），别看她们的身板单薄，但各个都有着出人意料的长项。小昂对于篮球的热情被重新激起了，他们的目标是——向县篮球大赛冠军进发！
藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。 《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？ AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了赛车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。
