大学即将毕业，美丽的女学生华织（片岡未来 配音）约上好友惠理香（谷口亜実 配音）、纪子（佐伯まさみ 配音），离开东京前往冲绳，计划借宿男友阿忠（根岸拓馬 配音）叔叔的别墅做毕业旅行。在当地，她们不断闻到死尸般的恶臭味。不久，长着尖刺长脚的怪鱼闯入别墅，它们以极快的速度奔走，并且攻击华织等人。很快她们发现，数以万计的步行鱼登陆冲绳海滩，引起巨大的恐慌。不止如此，东京方面也成为步行鱼的天下。担心阿忠的情况，华织毅然返回东京。面对这个末日般的城市，她如何才能找到阿忠呢？ 本片根据恐怖漫画家伊藤润二的同名原著改编。
今年，大学新鲜人泽木惣右卫门直保（坂口大助 配音）进入农业大学农学部，开始了全新的大学生活。其貌不扬的直保有一个天大的秘密，他能够看见存在于空气中的“菌”，甚至能够徒手抓住菌以及与其对话，这样的超能力对于农业专业的直保来说，无疑是如虎添翼，但是，麻烦也随之而来。 作为直保的亲梅竹马，直保的秘密无疑为家中经营酿酒行业的结城萤（斋贺观月 配音）创造了不少的便利。同时，外表意外老成的学长美里熏（小西克幸）和各方面都圆滚滚的川滨拓马（杉山纪彰 配音）都对直保产生了浓厚的兴趣。在崭新的校园里，直保和各式各样的菌在一起的生活就这样开始了。
為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。
