寒水寺忘忧大师坐化后，一口神秘的黄金棺材入世，掀起江湖纷争。各方势力针锋相对，雷无桀、萧瑟、唐莲、司空千落、天女蕊等相继卷入争端，一场围绕黄金棺材的故事即将上演。 策马江湖梦，倚剑踏歌行。 黄金棺材的秘密，逐渐浮现……
延续前一集的剧情，狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 David Schwimmer 配音）、河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 Jada Pinkett Smith 配音）以及企鹅们，为了能离开马达加斯加岛回到五光十色的纽约，对一架破旧的失事飞机进行维修改造，并成功起飞。当大家已经开始庆祝终于可以回到纽约时，飞机却意外降落，迫降到了非洲大草原上。在这儿，狮子亚历克斯终于见到了它的父母。但是由于生活习性上太多不一样，而且言行举止各异，使得这群纽约来的动物们显得格格不入。这群昔日纽约中央公园的动物明星们，在这野外艰难的环境中应该怎么办？虽然在这儿遇见了自己的同类，但因为习性不同，使得自己无法完全融入他们的群体。为了能融入环境，与同类们建立良好的关系，大家都是施展各种招式，笑料百出。
地脉方兴，天荒欲破。天荒世界，人族只是无比弱小的族种，面临严峻的生存危险，又是其他种族的血食。人族四大守护年事已高，还没能找到合适的接班人，最后四人决定，将自身的血肉融入天荒大地，凭天地意志选择新的接班人。 数年之后，姬水村的第一天才——姬小发为神秘女子禹雪所骗，失去了自身的命轮，从而沦落为废人，彻底自暴自弃。 这一天，护神山的人来到了姬水村，他们接走了资质出众的孩童，以作为下一任的护神山接班人。姬小发命轮破碎，无法一同前往，便只好前往狐爷家，进行修炼。另外一边，荒蛮野兽正在肆意入侵人族部落，一个接着一个的强大反派正慢慢得袭入人族部落，姬小发所面临的彼岸，又将会是什么？
