生化战士面临空前危机,这次他们不仅坠入一连串阴谋与诡计的黑暗之网中,还要面对伙伴背叛的考验,而新登场的敌人更是无比棘手。充满冒险动作的全新故事,华丽炫目的计算机动画场景,将带您再次进入最精彩刺激的生化战士世界。为了建立未来的新家园,六位生化战士必须返回美特吕完成最后的任务,但他们却发现这座昔日繁荣的城市已经笼罩在黑暗之中,空中有千丝万缕的蜘蛛网,成千上万的蜘蛛兽大军在城市中到处横行。当他们正准备对抗蜘蛛兽时,却遭到毒液攻击,并且变身为野兽般的模样,若不实时解毒,将永远变成邪恶的神魔战士。这时他们不仅要对抗蜘蛛兽大军,还要设法拯救被黑暗力量控制的村民,面对重重险恶,高贵的战士们还能坚持"团结,使命,责任"的信念吗?身怀绝技的战士挺身对抗身藏剧毒的敌人,经历这场严酷的考验之后,这些伟大的生化战士将再次开创一页全新的传奇,让他们的英名永远流传。
清水凑（上村祐翔 配音）曾经是一名水球运动员，但由于一场意外的发生，导致他在初中三年级的时候决定放弃水球这项深爱的运动，升上高中后，凑在阴差阳错之下结识了名叫冈荣太郎（西山宏太朗 配音）的男生。荣太郎是凑曾经的校友，因此十分了解凑身上所发生的那些悲惨的故事，亦十分向往能够和凑就读同一所高中。 城岛让（木村昴 配音）是水球社的社长，在他的苦心劝说之下，凑终于同意了加入水球社。曾经是游泳能手的网滨秀吾（齐藤壮马 配音）、个性十分容易冲动，大大咧咧的江尻武一（古川慎 配音）、温文尔雅性格平和的猪俣巴巴亚罗丰（畠中祐 配音），在学校里，凑很快就交上了朋友，也重新拾起了对于水球运动的热情。
经历过千辛万苦，千秋真一（关智一 配音）和野田惠（川澄绫子 配音）终于一个摆脱了恐机症，一个通过了入学考试，二人携手来到了古典音乐的圣地——欧洲。来到欧洲的野田妹对一切感到新鲜，新的环境，新的公寓，而最让野田妹感到开心的事是，终于可以和她最爱的千秋在一起了！可一切却没有野田妹想象的那般好，千秋在国际指挥比赛中大放光彩，得到了各大权威媒体的注意；而野田妹这边，有许多问题需要克服，不通的语言，新学校各类高手，还有千秋的不在身边……这些让野田妹在异国他乡感到孤独和寂寞，而更大的危机是，有天才女钢琴家也喜欢上的千秋，受挫的野田妹在钢琴上也遇到了瓶颈。 本片改编自漫画家二之宫知子的同名漫画，是动画系列的第二弹。
