剑与魔法的世界——艾斯克里亚。在这个世界里，人们生来就背负着等级与既定使命。战士、格斗家、僧侣、魔法师、盗贼、商人、猎人、咒术师、国王、贤者、勇者。而其中数量最多、毫无力量、最弱小的角色……“村民”。某日，一对村民父子遭遇魔物袭击。当那位青年飒爽登场，轻松击倒怪物时，那对父子惊得目瞪口呆。“镜浩二、村民……等级……999！？”达到 LV999 的极致境界，反抗既定命运的村民——镜浩二。魔族之巅的魔王之女——爱丽丝。两人相遇后，与伙伴们共同追寻魔族与人类共存的理想。在这个被命运赋予“对立”的世界里等待着他们的，将是这个世界不为人知的法则……
曾经，这是一个人类和魔法共存的世界，但一场意外的发生令魔法就此消身匿迹，一晃眼就是1000年过去，人类甚至连他们曾经拥有魔法这件事情都给忘记了。小日向满月（岛袋美由利 配音）是一名个性活泼开朗的女子高中生，不擅长拒绝的她无论别人拜托什么事情都会满口答应下来，因此在当地人缘非常的好。 一天，小日向满月邂逅了一位名叫新月艾尔涅丝塔深海（种崎敦美 配音）的神秘少女，看上去冷漠孤傲拒人于千里之外的少女，也被小日向满月的热情给融化了。在新月艾尔涅丝塔深海的带领之下，小日向满月第一次知道这个世界上存在着人偶阿尔玛诺克斯，同时亦得知了魔法并没有完全绝迹的真相。
故事发生在一个虚构的奇幻世界中，在这个世界里，每个人一出生起即拥有一本生命之书，所有人的一生，都会顺应着书中所写的脚本按部就班的发展下去。埃克斯（逢坂良太 配音）是其中的异类，因为他的生命之书竟然是空白的。为了寻找自己命运的线索，埃克斯踏上了旅途。 身世神秘的调音巫女蕾娜（上田丽奈 配音）、好爽奔放的强壮青年塔奥（江口拓也 配音）、我行我素不拘小节的少女诗音（久保田未梦 配音），一路上，埃克斯遇到了很多拥有异常生命之书的旅伴们，在结伴而行的过程中结下了深厚的友谊。
一人之下首部剧场版
作为动画3期的先行，以《摇曳百合：暑假时光+》为题的新作动画将分别于2015年8月和9月各放送1话，内容则是2014年11月上映的《摇曳百合：暑假时光》的后续
