《东京食尸鬼第三季》混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。对“喰种”进行驱逐、研究的CCG，为了达成某个命题，而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。并非“正经人类”的他们，与佐佐木琲世一等搜查官一起在“东京”面对的事物究竟是——！？
连点头之交都没几个的我──前原真树交到了第一个朋友——朝凪海。男生们都说朝凪同学是「班上第二可爱」，而且很照顾天真烂漫的No.1美少女天海同学。这样的她只有在周五的放学后，会偷偷来我家玩。从平常能干的模样，实在难以想像私底下的她这么率直又爱撒娇。 这是低调男与第二女主角之间的真实「朋友」恋爱喜剧。
罗森是一战中意大利空军的王牌飞行员，但却被施了魔法变了一头猪。虽然变了猪，但罗森还是继续他的老本行，成了一位赏金猎人，专门打击在亚地里亚海空域作恶的空中劫匪。红猪侠一时威名远扬，令劫匪们闻风丧胆。匪徒们为了对付罗森，请来了超级飞行员卡基斯。卡基斯在于罗森对决中趁他发动机故障将其击落。罗森把飞机送到老朋友比克罗处修理时，遇上了比克罗的孙女菲欧。菲欧帮罗森修好了飞机，两人一起再度翱翔蓝天对付空中劫匪。 这时，卡基斯出现了，他对菲欧一见钟情。为了争夺菲欧的爱，卡基斯向罗森提出决斗。于是两人再次浴血蓝空。
发生一连串离奇的死亡案件后，公诉检察官莎拉·辛克莱和犯罪特侦处的探员詹姆斯·布拉德，发现一个以生化面具为核心、前所未见的诡异阴谋。
