由绝望中转生的最强贤者，到400年后的世界一展外挂威能！大贤者艾福达尔从现代转生至异世界后，将人生的一切都花费在研究魔导上。当他了解到自己才能的极限，到达绝望与后悔的尽头后－－划下了生命句点。在那之后过了400年……艾福达尔成功地第二次转生，不仅保有前世的魔术知识与力量转世重生，更再度以登上魔导巅峰为目标。然而新世界的魔法文明已衰退，他的魔法竟然变成了奇迹般的神乎其技－－贤者从绝望中转生的犯规级学院奇幻故事，在此揭开序幕！
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
所谓勇者，是世间最为残酷的刑罚。犯下大罪之人被制造为“勇者”，其刑罚便是和魔王战斗。哪怕死了也会被复活起来，无法享受死亡的安宁。被判处勇者刑的前圣骑士团团长赛罗·弗巴茨，率领着由各种性格古怪之人构成的刑罚勇者部队，奔走于战斗的最前线。在残酷的战场上，赛罗与最强的生物兵器之一，剑之“女神”缇欧丽塔相遇了。“在将敌人歼灭之后，要为我献上赞赏……以及抚摸我的头。”为了活下来，以及报复陷害自己的人——赛罗与“女神”订下契约，在这令人绝望的世界中，投身于炽烈的斗争与阴谋的漩涡。
