《东京食尸鬼第三季》混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。对“喰种”进行驱逐、研究的CCG，为了达成某个命题，而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。并非“正经人类”的他们，与佐佐木琲世一等搜查官一起在“东京”面对的事物究竟是——！？
高中一年级学生白石纯太，是个身边人都注意不到的角色。是个即使去拍了集体照也不会被发现最后还得被P上去的毫无存在感的“路人”男孩。 但是偏偏只躲不过同班同学、“女主角级”的美少女久保的目光，今天也要一点点向你靠近！ 是谁成为了谁的特别存在，但这份感情距离可以被称作“恋爱”，却又对二人来说尚在萌芽之时。 “恋爱喜剧”前的两步之遥，是女主角×平凡男孩的青春期甜蜜喜剧。
为了拍摄心中理想的怪兽电影，这群萌趣活宝四处物色演员，竟然真的集齐了各式怪兽，上演疯狂大乱斗！
寄宿大学生高桥美咲（樱井孝宏 配音）和大作家宇佐见秋彦（花田光 配音）延续着第一部，仍然继续着他们的恋爱故事。在秋彦的编辑相川小姐和丸川书店的老板的怂恿下，美咲答应参加秋彦的菊川赏得奖纪念酒会。在路途上，美咲意外邂逅了秋彦的哥哥春彦（鸟海浩辅 配音）。小兔老师和家人的关系都很恶劣，夹在中间的美咲左右为难。而难上加难的是，春彦展开了追求美咲的攻势，不是送花就是送草莓，让小兔老师的低气压降到最小值。小兔老师不仅提防着春彦，还得提防着美咲的同学角，但没想到角真正中意的是他自己。 美咲和小兔的恋爱道路上挫折不断。而另外两对，上条弘树（伊藤健太郎 配音）和草间野分（神奈延年 配音）；高槻忍（岸尾大辅 配音）和宮城庸（井上和彦 配音）的感情之路也波折连连。但结局好一切都好。
