故事发生在2029年，被病毒袭击的日本陷入了混乱之后被名为“GHQ”的暴力组织全面接手，政府逐渐成为了傀儡。在这样动荡的大环境下，樱满集（梶裕贵 配音）只是一名平凡的高中生，过着属于他的平凡生活，直到那个叫做楪祈（茅野爱衣 配音）的少女出现在他的眼前。 祈的真实身份为“葬仪社”的成员，这个社团以从GHQ的手上夺回日本自治权为目标不断进行着危险而残酷的战争。在组织首领恙神涯（中村悠一 配音）的引导之下，集成为了组织的一员，结识了同僚筱宫绫濑（花泽香菜 配音）和鸫（竹达彩奈 配音）等人。随着战斗的升级，各种迹象显示出集似乎拥有着神秘的力量，而躲在诸多敌人背后的究竟是怎样强大的存在，众人无从而知……
国江田计（阿部敦 配音）是拥有着极高人气的国民级主播，他拥有英俊的外表和温柔的个性，总是以无懈可击的完美形象出现在大众面前。可实际上，国江田计拥有一颗非常腹黑的内心，他从来都瞧不上那些拜倒在自己脚下的粉丝们，认为他们都是没有脑子的愚民。 一天，身着便服邋邋遢遢的国江田计不小心撞到了正在骑自行车的男子，之后才发现原来这个人正是自己从前采访过的动画作者都筑潮（川原庆久 配音），幸运的是，都筑潮并没有认出国江田计的身份。因为受伤，都筑潮无法完成工作，协助他的任务自然落到了始作俑者国江田计的头上。
发生一连串离奇的死亡案件后，公诉检察官莎拉·辛克莱和犯罪特侦处的探员詹姆斯·布拉德，发现一个以生化面具为核心、前所未见的诡异阴谋。
本剧讲述超级飞侠与超级宠物们乘着迷你基地前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在冰岛海域，他们通过声波探测设备，帮助海豚宝宝找到了海豚妈妈；在喜马拉雅山脉附近，他们把快要滚下山坡的小男孩基玛和爸爸以及巨雪人宝宝安全救下。尽管困难不断，但超级飞侠和超级宠物们每次都会带着炫酷的装备，圆满地解决问题。
